ZEISS ZEN Intellesis für die Bildsegmentierung in der Mikroskopie

Nutzen Sie das Potenzial von Deep Learning für die einfache Segmentierung Ihrer Bilder

So beeindruckend mikroskopische Bilder auch sind, ihr wahrer Wert steckt in den darin enthaltenen Daten. Die Bildsegmentierung ist aktuell eine der größten Herausforderungen in der Mikroskopie. Sie bildet die Grundlage für alle nachfolgenden Schritte der Bildanalyse. ZEN Intellesis nutzt Deep Learning und Python, um im Handumdrehen robuste und reproduzierbare Segmentierungsergebnisse zu liefern, auch wenn der Benutzer unerfahren ist. Sie brauchen die Software jetzt nur einmal zu trainieren, dann kann ZEN Intellesis anschließend Hunderte von Bildern automatisch segmentieren. Das spart Zeit und minimiert die Beeinflussung durch den Benutzer.

Highlights

Nutzen Sie Deep Learning für die Segmentierung Ihrer Bilder

Um aus guten Bildern zuverlässige Daten zu erhalten, müssen Sie häufig mehrere Objektklassen in zahlreichen Bildern segmentieren. Mit ZEN Intellesis können Sie jetzt Ihr Expertenwissen nutzen, um die Software mithilfe einiger Bilder zu trainieren. Sämtliche zeitaufwändigen Segmentierungsschritte für Hunderte ähnliche Bilder werden dann von den leistungsstarken Deep-Learning-Algorithmen und der Python-Infrastruktur des ZEN Intellesis Softwaremoduls ausgeführt. Mithilfe der Multi-Channel-Elementextraktion lassen sich selbst komplexe multidimensionale, multimodale Daten unabhängig von deren Herkunft analysieren.

Genießen Sie eine reibungslose Integration in Ihre Arbeitsabläufe

Das Softwaremodul ZEN Intellesis vereinfacht die Verwendung von Deep Learning: Sie laden einfach Ihr Bild, legen Ihre Klassen fest, markieren Objekte, trainieren Ihr Modell und führen die Bildsegmentierung durch. Wenn Sie mit den Ergebnissen zufrieden sind, können Sie Ihr trainiertes Modell für die Segmentierung und Analyse vollständiger Datensätze anwenden. ZEN Intellesis ist vollständig in den Bildanalyseassistenten der ZEN Imaging Software integriert. Die Integration in das Mess-Framework von ZEN stellt sicher, dass alle wertvollen Metadaten zusammenbleiben und für weitere Bearbeitungsschritte verfügbar sind.

Analysieren Sie multimodale Bilder aus unterschiedlichen Quellen und Formaten

Mit dem Softwaremodul
ZEN Intellesis können Sie multidimensionale Bilder aus den
verschiedensten Quellen ganz einfach segmentieren, zum Beispiel:

Weitfeldmikroskopie
Hochauflösende Mikroskopie
Fluoreszenzmikroskopie
Markierungsfreie Mikroskopie
Konfokale Mikroskopie
Lichtblattmikroskopie
Elektronenmikroskopie
Röntgenmikroskopie

Außerdem können Sie sämtliche Bildformate analysieren, welche die ZEN Imaging Software lesen kann, wie CZI, TIFF, JPG, PNG, TXM und alle mit Bio-Formats kompatiblen Bilder.

Anwendungen in der Biologie

1. Scratch Assay

Einzelbild einer Zeitrafferaufnahme.

Segmentierungsergebnis von ZEN Intellesis - Kratzfläche (Türkis), Zellschicht (Orange) und Mitosezellen (Rot).

Messung der Größe des Kratzerbereichs mit dem ZEN-Bildanalyse Modul über die Zeit

Basierend auf den Segmentierungsergebnissen von ZEN-Intellesis wurde die Größe des Kratzerbereichs mit dem ZEN-Bildanalyse Modul über die Zeit gemessen.

2. Dendriten und Dornenfortsätze

Dendrit eines Neurons, das grün fluoreszierendes Protein exprimiert. Mit strukturierter Beleuchtung auf Elyra aufgenommenes Bild, das Dornenfortsätze auf einem Dendriten zeigt.